卫生部中日友好医院连续8年获“首都精神文明单位标兵”和“中央国家机关精神文明单位标兵”光荣称号, 并曾被外国人在京协会评为“外国人在京就医国有医院满意率第一单位”。2003年，我院被定为全国保持共产党员先进性教育活动试点单位之一，同年，在抗击非典斗争中被定为临时SARS定点医院，在卫生部党组的直接领导和全院职工的共同努力下，出色地完成了任务。
展望未来，医院将始终坚持以人为本的科学发展观，努力实现“让患者满意，让职工满意”，致力于建立和完善医院的质量管理体系、经营管理体系、诚信服务体系、创新体系和人才发展体系，求真务实，锐意进取，为把医院建设成建成国内一流、国际知名，以疑难病、危急重症诊治为重点，以中西医结合为特色的大型综合性现代化医院而不懈地努力。
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