根据1979～1985年全国三个地区45所医院儿科住院病人调查，尿路感染占6%。另据报道，新生儿尿路感染的发病率为2.7%，男性新生儿的尿路感染较女性多(男∶女=4∶1)，这可能是由于男婴尿路畸形多于女婴的缘故。亦有人认为，与男婴的包茎藏污纳垢有关。单纯性尿路感染者，一般很少发生严重的肾实质损害。若伴有显著尿流梗阻，则可导致患儿的肾发育障碍和肾疤痕形成，造成永久性肾实质损害，甚至发展为慢性肾功能衰竭，其后果远较成人严重。如能给予合理的治疗，往往可以阻止向这种不良结局发展的倾向，因此，新生儿尿路感染的及早诊治具有重要意义。

关于本病的临床表现，不同的年龄段发病各有其不同特点。新生儿尿路感染的临床表现以非特异症状为主，主要是发热、惊厥、烦躁、呕吐、腹胀、便秘及麻痹性肠梗阻、皮肤苍白或青紫、呼吸不规则、体重不增加等。黄疸却最为常见(发生率达77%～100%)，甚至是早期唯一的症状，且常骤起(新生儿尿路感染伴发黄疸的机理尚未完全清楚，多数学者认为与溶血和肝细胞损害有关)。部分患儿排尿时可出现痛苦面容及前屈体位等，体检可见营养不良。半数以上患儿可无发热，甚至体温不高。部分病例可有轻度肝脾肿大，大多数患儿都有不同程度的贫血，血清总胆红素升高(生后1周内出现黄疸以未结合胆红素升高为主，而2～3周后出现者以结合胆红素升高为主)。尿培养以大肠杆菌为主，其次为产气杆菌，部分患者血培养也阳性(且细菌与尿培养一致)。有的病例可伴有轻度肝肾功能异常，但随着疾病的好转而迅速恢复正常。不少患儿只表现为无症状性菌尿。

新生儿尿路感染与成人有很大差别，临床特点是中毒症状严重，尿路局部症状轻微。某些患儿甚至仅有唯一的黄疸症状而被忽视本症。因此，对于新生儿原因未明的黄疸，要想到细菌性尿路感染的可能，以便得到及时处理。

3岁以后的临床表现已比较典型，尿路刺激征、血尿等较常见，有些不典型病例表现为急腹症样(类似阑尾炎)，但此时尿标本已比较容易收集，诊断较易。小儿3岁以后，由于很少使用尿布，本病发病率显著降低。